馬蹄寺平均海拔在2580米左右。馬蹄寺位于甘肅省肅南裕固族自治縣馬蹄藏族鄉境內，北距張掖市市區65公里，是集石窟藝術、祁連山風光和藏族風情于一體的旅游區。馬蹄寺因傳說中的天馬在此飲水落有馬蹄印而得名。傳說中的馬蹄印跡現存于普光寺馬蹄殿內，成為鎮寺之寶。