秘魯有沙漠。分別是納斯卡荒漠和阿塔卡馬沙漠。納斯卡荒漠在利馬以南約四百公里，位于秘魯海岸的干旱的草原上，占地約450平方公里。阿塔卡馬沙漠位于南美洲西海岸中部的沙漠地區，主體位于智利境內，部分位于秘魯、玻利維亞和阿根廷，總面積約為1813萬平方公里。