河豚身上最毒的部分是卵巢、肝臟兩個部位，其腎臟、血液、眼、鰓和皮膚的毒素次之，河豚的肌肉中不含毒素，但河豚死后其內臟中的毒素會深入到肌肉，這時魚肉中也會含有少量毒素，河豚的生殖周期會影響其毒性大小，晚春初夏季節時，懷卵的河豚毒性最大。