新疆棉和普通棉的區別在于形態特征、產地、作用等。1、形態特征：新疆棉是長絨棉品質優良，其纖維柔長；而普通棉花，纖維白色或白中帶黃。2、產地：新疆長絨棉，產于新疆各地，是我國長絨棉第一產區；普通棉花產區為江淮平原、江漢平原等地。3、作用：新疆棉透氣性好，保暖效果好；普通棉花吸濕性較強，而且染色性比較好，易于上色。