（1）微生物的管理

正在進行消化的污泥中，微生物主要是細菌，所以不能像好氧處理中作為指標生物的各種微型動物那樣，依靠鏡檢來判定污泥的活性。為此，目前是采用最敏感的指示微生物代謝影響的指標來間接地反映微生物的活性，與此同時，必須研究出一種能迅速掌握消化池內生物量的測定法，并能控制厭氧細菌濃度和數量，其中之一就是DNA和ATP，不過它并沒有發展到普遍使用的階段。為了掌握消化狀態而作為消化池的管理指標來使用的指標有消化氣產生量、消化污泥中的有機物含量、揮發性酸濃度、pH值、堿度等。

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最敏感地反映消化抑制過程的是氣體產生量，氣體產生量減少就是消化作用開始受到抑制的征候，因此必須每天測定氣體的產生量，pH值降低會引起有機酸的積累，因而它是抑制氣化的證據，在污泥消化中，如消化正常則pH值很少在7.0以下。在消化順利進行的大多數情況下，揮發性酸為300～500mg/L；堿度為2000～2500mg/L的范圍。

（2）重金屬對消化的抑制

為了降低重金屬的毒性，提高pH值，在消化池中投加熟石灰、液氨和硫化鈉等。

（3）揮發性酸積累對消化的抑制

在消化池的管理上，最重要的是避免超負荷投加以及不使消化溫度降低。超負荷和溫度對厭氧消化的影響比對好氧處理的影響更為顯著。而且與活性污泥等相比，其停留時間明顯加長，恢復要很長時間。因此一旦消化出現了被抑制的征候就必須迅速采取對策。當揮發性酸濃度高時，加氨調節pH值必須要慎重進行。氨達到1500～3000mg/L時就能使消化作用受到抑制，如果在正常操作的消化池中，出現消化抑制時其原因有可能是摻入了有害物質和超負荷等。

一般認為，一級消化池的污泥停留時間需要10d以上。如果少于10d，則消化池內的生物累積率比微生物增長速度增大，因而，微生物被挾走致使消化作用惡化，如果揮發性物質的負荷在3.0kg/（m3·d）以內，則消化仍然可以進行，但一旦超過3.0kg/（m3·d）以上時，則就不能使消化正常進行。