與糞菌移植手術相比，口服糞便微生物藥物更加方便、風險更低、具有更好的適應性、在大規模生產中需要具有一定的普適性。國內首款口服糞便微生物藥正式獲批上市。這一消息在醫學界和公眾中引起了巨大轟動。口服糞便微生物藥物的問世帶來了新的治療方式，雖然其是否能完全替代目前的糞菌移植治療還需進一步觀察，但其方便、安全的特點無疑會極大地影響未來的治療領域。

傳統的糞菌移植治療需要從熟悉的移植者身上收集糞便樣品，將其經過篩選、處理、培養等多個步驟后，再通過灌腸的方式直接給藥。這種過程不僅繁瑣復雜，需要專業的團隊和設備支持。口服糞便微生物藥則可以像普通藥品一樣，直接口服。這使得治療過程更加簡單實用。

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糞菌移植過程中，由于異體細菌的存在，潛在的病毒、腸道感染等問題都是無法避免的。而口服糞便微生物藥物的原料主要來自于同一患者，各個人體自身的微生物組成是不同的，所以在該藥物的生產過程中，會針對患者本身的微生物進行定制制備。這避免了異體細菌帶來的風險，減小了治療的風險。

糞菌移植手術需要在病人的消化系統內直接投放異體菌群，受環境和胃液的影響，異體菌的存活率和治療效果可能會受到影響。口服糞便微生物藥物經過了胃和腸道，是長距離投送，也許可以更好地適應不同人群的胃腸道環境，提高治療效果。藥物生產中可以滿足更多人的需求。口服糞便微生物藥物在臨床上有著諸多優勢。是否能夠取代現有的糞菌移植手術還需觀察和評估，但這一新的治療方式無疑給醫學界帶來了新的思考和探索方向，為治療胃腸道疾病提供了更加便捷、安全、有效的選擇。