1、放入冰箱。若是新鮮墨魚，直接放入冰箱冷藏室。但是在放入冰箱的時候最好選擇分裝的方法，這樣可以防止想要吃的時候反復解凍，不僅會造成細菌繁殖，同時還會破壞到墨魚的口感以及營養。

2、密封保存。這種方式不管是針對墨魚干還是新鮮墨魚都是比較實用的，可以購買真空袋，然后將墨魚放入袋子中將其中的空氣抽出，然后放在陰涼干燥的地方或放入冰箱。雖然說這種方式可以起到保存墨魚的目的，但建議最好在半個月的時間內吃完，因為食物儲存的時間過長，不僅會導致營養流失，同時還很可能對身體造成不利影響。

3、內臟去除法。可以將新鮮墨魚的內臟、墨魚皮以及墨汁都去除之后，在表面撒上一些鹽粉抹勻開。如果兩三天就可以吃完，放入冰箱冷藏室即可，如果需要更長的時間才能吃完，就需要放在冰凍室。