1、體色不同。花鰱腹部呈白色或灰黃，背部和頭部呈蒼黑色，整體來說顏色要深，體兩側散布有黑色的斑點；而白鰱則體兩側為銀白色，只是背部有一些青黑色。

2、頭部不同。花鰱的魚頭占魚身的比重大，甚至于有些花鰱的魚頭會接近半個魚身大小。反觀白鰱魚頭則較小。

3、腹棱不同。一般的魚從腹部到**處都有一條硬的梗，水產學上稱之為腹棱，花鰱的腹棱僅從腹鰭基部至**處有，而白鰱的腹棱則自胸鰭下方直至**，這個是最直觀的分辨方法。

4、魚鰓不同。兩種魚在鰓部是有很大區別的，雖然都是濾食性的魚，花鰱鰓部的鰓耙較稀疏，自然環境下花鰱主要以浮游動物為主；而白鰱其鰓耙較花鰱的要密不少，而且十分發達，主要以浮游植物為主。