農業生產者生產農產品享受免征增值稅的優惠政策，納稅人從農業生產者手中購進農產品可以憑農產品銷售發票或農產品收購發票上注明的買價和扣除率計算抵扣進項稅額。

從農業生產者手中免稅農產品，農業生產者享受免稅優惠政策，農業生產者若屬于單位性質，可以自行開具發票，即開具農產品銷售發票（實質為普通發票）；若農業生產者無法自行開具發票的，則可以由收購單位開具農產品收購發票。農產品銷售發票以及農產品收購發票除了開具方不同外，購買方具體抵扣進項稅額是一致的。注意開具的農產品銷售發票以及農產品收購發票稅率欄選擇“免稅”而不是零稅率。

對于一般納稅人從農業生產者手中購進農產品，用于準予抵扣增值稅進項稅額的情形，憑取得的農產品銷售發票或農產品收購發票上注明買價計算抵扣進項稅額，扣除率為9%。

準予抵扣的進項稅額=農產品銷售發票或農產品收購發票注明買價×9%

若納稅人購進農產品后用于生產適用13%稅率的貨物，可以加計抵扣1%。加計抵減的1%在生產領用環節再進行稅務處理，即實際扣除率為10%。(www.ws46.com)

若一般納稅人從農業生產者手中購進農產品后，用于不得抵扣增值稅進項稅額的情形，即使取得農產品銷售發票或開具了農產品收購發票，也不得抵扣進項稅額。根據《關于全面推開營業稅改征增值稅試點的通知》（財稅[2016]36號），用于免稅項目，簡易計稅項目，集體福利以及個人消費的進項稅額不得從銷項稅額中扣除。實務中，比如一般納稅人企業購進農產品后用于企業食堂，為員工提供免費午餐，屬于購進農產品用于集體福利，其進項稅額不得抵扣；再比如企業購進農產品后繼續生產為免稅初級農產品，屬于用于免稅項目，不得計算抵扣進項稅額。

對于小規模納稅人從農業生產者手中采購農產品，由于計稅方式的不同，取得農產品銷售發票或開具農產品收購發票也不得計算抵扣進項稅額。小規模納稅人增值稅采取簡易計稅方式，應納增值稅稅額為不含稅銷售額與適用征收率的乘積，不存在抵扣進項稅額。且根據《財政部 稅務總局關于對增值稅小規模納稅人免征增值稅的公告》（財政部 稅務總局公告2022年第15號）規定，小規模納稅2022年4月1日至2022年12月31日，適用3%征收率的應稅銷售額免征增值稅。