蝙蝠全身骨質(zhì)輕，頭骨愈合程度較高，肩帶發(fā)達，胸骨具龍骨狀突起。后肢脛骨、腓骨退化。耳殼發(fā)達，常具發(fā)達的耳屏或?qū)Χ痢Ｒ砟ぁ⒍⒋降忍幱胸S富的感覺毛。顏色多樣，大多是褐色、灰色和黑色。蝙蝠前肢特化，尤其是骨骼有較大的變化。肱骨顯著短于橈骨（前臂骨），尺骨退化；除第一指不特別延長，末端有爪，其余掌骨和指骨均特別延長，各掌、指骨間生有皮膜，向后一直與后肢和尾部相連。連接各指間的皮膜稱翼膜，前肢肱骨和后肢間皮膜稱側(cè)膜，前肢肱骨和前臂骨前的皮膜稱前翼膜，連接左右后肢和尾部的稱股間膜。股間膜其膜緣常有距，起支撐股間膜作用，距外側(cè)皮膜稱之為距緣膜。后肢短小，大腿部與身體呈直角且位于同一平面。側(cè)膜常止于脛下部、踵部或趾基部。后肢足部完全位于皮膜以外，五趾均具爪，用于鉤掛。蝙蝠牙齒齒冠原始，原始齒型相比，缺第一對門齒和第一對前白齒。門齒弱，犬齒發(fā)達，基部常有粗壯的基嵴。前臼齒有分化，最后一枚前臼齒顯著的大，其齒尖可達犬齒齒尖的高度，臼齒齒冠呈“W”形。蝙蝠雄性具有顯著的陰莖，但一般無陰囊，睪丸留于腹腔內(nèi)或會陰部。雌性具雙分子宮或雙子宮，繁殖時形成盤狀胎盤。胸部有一對乳頭。耳殼發(fā)達，常具發(fā)達的耳屏或?qū)Χ痢Ｒ砟ぁ⒍⒋降忍幱胸S富的感覺毛。