含有劇毒物質廢水，如含有一些重金屬、放射性物質、高濃度酚、氰等廢水應與其他廢水分流，以便于處理和回收有用物質。一些流量大而污染輕的廢水如冷卻廢水，不宜排入下水道，以免增加城市下水道和廢水處理廠的負荷。這類廢水應在廠內經適當處理后循環使用。在使用有毒原料以及產生有毒的中間產物和產品的生產過程中，采用合理的工藝流程和設備，并實行嚴格的操作和監督，消除漏逸，盡量減少流失量。最根本的是改革生產工藝，盡可能在生產過程中杜絕有毒有害廢水的產生。如以無毒用料或產品取代有毒用料或產品。