建成啟用時間不同、分工不同。1、分工不同：T4候機樓可以辦理除廈航、南航和河北航空的其他所有國內航班，如山航、海航、東航、春秋航空等22家機場代理的國內航空公司的航班。T3候機樓可以辦理港龍航空、立榮航空、全日空航空等19家國際和地區間航班以及廈航、南航和河北航空的國內航班。2、建成啟用時間不同：T3是1996年建成，并啟用。T4是2014年建廈門高崎機場t3停車費成，并啟用。