過度依賴于征稅，在軍事戰略還有軍事組織上存在著非常明顯的問題，最后在政治上會有一些錯誤。因為征收的費用比較高，而且推出強制性的征兵行為，加上內部隱含著很多的問題。種種問題的出現，導致整個部隊根本就不像部隊，后期只能夠進入到滅亡的階段。

過度依賴征稅

過度依賴征稅對所有的農民造成過度的剝削，容易引起廣大農民的反感。由于長時間的戰亂以及經濟蕭條，大西國農民聯軍只能夠通過高額的征稅，有效維持軍費。李自成當時曾經規定，起碼需要一半谷稅，一半錢糧。這意味著所有的農民在平時已經無力承受。大西國農民聯軍甚至還會采取一種抽丁征兵的制度。這其實屬于一種強制性的征兵行為，更是加劇所有農民的不滿。

軍事戰略和軍事組織存在問題

在南明政府內部還有無數的爭論，根本無法形成一種統一的體系。李自成在軍事組織這一方面毫無章法，缺乏經驗，隱含著許多問題，所創建的部隊根本就不是有效的部隊。軍隊中普遍會存在一些懶散情況，貪污腐敗情況，軍紀很是松散。無數的士兵，從來沒有經過嚴格的訓練，不懂得如何指揮。因為內部存在許多問題，這自然容易導致戰斗力受到影響。

政治上的錯誤

李自成在重要的政治問題上也曾經犯下過錯誤，同時彌天大錯。比如在面對劉宗敏，還有董一元的處理上面就會有著無數的爭議，很明顯這些處理的方法根本不正確。李自成在此時直接選擇殺一儆百的制度，這種制度相對比較嚴格，無形之中就會增加他和農民之間的矛盾。與此同時，會影響到李自成在軍隊中的威望，難怪大部分的人都無法接受。