一般納稅人從小規模納稅人處采購農產品取得的小規模納稅人開具的3%征收率的增值稅專用發票可以憑發票上的金額和9%的扣除率，計算抵扣準予抵扣的進項稅額。若一般納稅人采購的農產品用于生產適用13%稅率的貨物，在生產領用環節還可以加計1%扣除，即扣除率達到10%。

根據財政部國家稅務總局2023年第1號文件規定，2023年12月31日，小規模納稅人適用3%征收率的應稅銷售額減按1%征收，這條優惠政策在2020年以及2021年均有規定，2022年是適用3%征收率的應稅銷售額免征增值稅。

在2021年，國家稅務總局的答疑中，曾提過對于一般納稅人而言，從小規模納稅人手中采購農產品取得的1%稅率的專用發票，不得按照9%(或10%）扣除率抵扣增值稅。2023年同樣如此，取得1%稅率的專票不得計算抵扣準予抵扣的進項稅額，僅能按照1%稅率憑票勾選抵扣。

站在2023年，小規模納稅人除了3%減按1%征收的優惠政策，還有月度應稅銷售額不超過10萬元的(季度應稅銷售額不超過30萬元的)，免征增值稅的優惠政策。在這兩項減免稅優惠政策下，對于小規模納稅人，不超過免稅限額的，一般更愿意開具1%稅率的普通發票，這樣可以享受小規模免稅優惠政策。若超過免稅限額的，則更愿意開具1%稅率的普票或1%稅率的專票，這樣可以享受3%減按1%稅率的減稅優惠政策。

遇到這種情況，不管開具的是1%稅率的普票還是1%稅的專票，一般納稅人均不能按照9%(或10%）扣除率計算抵扣進項稅額，對于一般納稅人是一種損失。

如何規劃呢，可以考慮與小規模供應商協商，讓小規模納稅人加稅點開具專票。小規模納稅人開具3%稅率的專票，這部分銷售額就需要按照3%征收率計算應繳納的增值稅稅額，若小規模納稅人這部分銷售額原本可以享受免稅政策，由于開具了3%稅率專票，需要繳納3個點的增值稅，同時需要繳納3個點增值稅稅額對應的12%的附加稅費(城建稅、教育費附加以及地方教育費附加），在不考慮企業所得稅的情況下，合計稅點為3.36，考慮企業所得稅(以標準稅率25%為例)，合計稅點為3 3×12%×(1－25%)=3.27個稅點。

比如小規模納稅人原本要開具1%稅率普票，加3.27個，甚至加4個稅點要求其開具3%稅率專票，對于小規模納稅人稅費轉嫁給了一般納稅人，沒有損失。而對于采購農產品的一般納稅人企業而言，取得3%稅率專票，可以計算抵扣9%(或10%)增值稅，同時少交抵扣增值稅稅額對應的附加稅費，以生產適用13%稅率的貨物為例，扣除率為10%，合計抵扣的稅點為10 10×12%×(1－25%）=10.9。

小規模加收稅點的情況下，對于一般納稅人付出3.27個稅點，抵扣10.9個稅點，綜合來看，多抵扣6.63個稅點。計算出小規模納稅人因開具3%稅率的專票而放棄減免稅政策多承擔的稅點，目的是為了協商，對于一般納稅人要明確小規模實際多付出的稅點，這是加收的最低稅點，是站在稅務角度小規模納稅人愿意放棄減免稅的最低要求。(www.ws46.coM)

一般納稅人明確自己取得3%稅率專票可以少繳納的稅點，是一般納稅人可以承受的最高加稅點，在兩個稅點之間，對于小規模納稅人以及一般納稅人均屬于雙贏。