一般納稅人取得增值稅普通發票，一般情況下不得抵扣進項稅額，因為大部分采購活動取得的普通發票不是合規的增值稅抵扣憑證，但是企業所得稅稅前扣除的有效憑證。特殊情況下，某些明確規定的普通發票可以抵扣進項稅額，包括憑票抵扣以及計算抵扣。

特殊情況下，可以用來抵扣進項稅額的普通發票主要包括一般納稅人購買車輛取得機動車銷售統一發票，采購農產品取得或開具的農產品銷售發票及農產品收購發票，員工等出差期間取得的旅客運輸增值稅電子普通發票、橋閘通行費統一發票以及通行費增值稅電子普通發票，員工出差期間取得的注明旅客身份信息的航空電子客票行程單、注明旅客身份信息的鐵路車票以及注明旅客身份信息的公路、水路等其他客票。

目前，除了以上稅務機關明確可以用來抵扣進項稅額的普通發票外，增值稅的主要抵扣憑證為增值稅專用發票、海關進口增值稅專用繳款書以及解繳稅款完稅憑證。同時，實際抵扣進項稅額時，除了滿足抵扣憑證合規外，還需要滿足實質用途要求，比如用于簡易計稅項目、免稅項目、集體福利以及個人消費取得的進項稅額不得抵扣；購進的貸款服務、餐飲服務、居民日常服務以及娛樂服務取得的進項稅額不得抵扣；非正常損失對應的進項稅額不得抵扣。

一般納稅人采購車輛，取得的機動車銷售統一發票憑發票；員工出差等取得的旅客運輸增值稅電子普通發票以及通行費增值稅電子發票憑發票上的稅額抵扣進項稅額。

農產品銷售發票（銷售方開具或到稅局代開）以及農產品收購發票（采購方開具）準予抵扣的進項稅額為發票上注明的金額與扣除率的乘積。

即準予抵扣的進項稅額=發票上注明的金額×扣除率

扣除率為9%，若納稅人購進農產品用于生產適用13%稅率的貨物，可以在生產領用環節，加計1%抵扣，即實際扣除率為10%。

橋、閘通行費統一發票，需要計算準予抵扣的進項稅額，準予抵扣的進項稅額=橋、閘通行費發票上注明的金額÷（1 5%）×5%。

注明旅客身份信息的航空運輸電子客票行程單，準予抵扣的進項稅額=（票價 燃油附加費）÷（1 9%）×9%。

注明旅客身份信息的鐵路車票，準予抵扣的進項稅額=票面金額÷（1 9%）×9%。

注明旅客身份信息的公路、水路等其他客票，準予抵扣的進項稅額=票面金額÷（1 3%）×3%。